代谢组学作为系统生物学的重要组成部分,致力于研究生物体或组织中所有小分子代谢物的变化规律。在代谢组学研究的征程中,先进的技术和试剂犹如闪耀的星辰,照亮前行的道路。SCIEX试剂凭借其性能,在代谢组学研究中展现出了诸多创新应用,为科研工作者带来了新的研究视角和突破。
高覆盖靶向代谢组学的革新
高覆盖靶向代谢组学是当下代谢组学实验室积极探索的前沿领域。SCIEX试剂在这一领域大放异彩,以其优势推动着研究的深入发展。例如,在对紫薯的研究中,利用SCIEX QTRAP®系统,结合SCIEX TripleTOF™系统的高覆盖特性,构建了一套高效的研究方案。首先,在SCIEX TripleTOF™系统上运用IDA方法对紫薯提取物进行高覆盖度测定,随后将鉴定出的化合物构建MRM离子对,再借助SCIEX QTRAP®系统开展靶向代谢组学测定。通过这流程,成功检测出紫薯中的203种代谢物,涵盖氨基酸、核苷、糖类、脂质、黄酮及黄酮苷类、花青素类、酚酸类等多种成分。该方法灵敏度很高,检测速度快,化合物覆盖度广,且特异性良好,正负切换同时检测功能结合Scheduled MRM™功能,仅需35分钟即可完成一针样品中203个化合物的检测,大大提高了检测效率。同时,QC样本中91%化合物的RSD在15%之内,充分证明了仪器和方法的出色重现性。
助力非靶向与靶向结合的代谢组学研究
代谢组学数据的复杂性使得某些特征峰的鉴定面临挑战,而SCIEX试剂在非靶向和发现代谢组学解决方案中展现出其价值。其侧重于采用现代方法,如SWATH®采集方法,结合全面的统计手段以及合作伙伴开发的工具,通过数据简化和去卷积鉴定相关代谢物,生成包含大量可重现代谢物信息的全面数据。例如,在组学覆盖度不受影响的前提下,将全面的数据采集策略与先进的数据处理流程相结合,对采集的数据进行去卷积,显著提高了发现全新生物相关差异代谢物的可能性。同时,SCIEX的相关软件,如XCMSPlus提供先进的统计式一遍过数据处理功能,帮助科研人员找到重要的化合物并进行鉴定和确证;LibraryView™软件则可创建、管理MSMS谱库,为代谢物的鉴定提供有力支持。在实际研究中,如针对2型糖尿病的研究,借助SCIEX ZenoTOF 7600高分辨系统搭载的Zeno™trap离子阱技术,开发出HRMS-MRM MS模式新方法,一次进样便能同步分析非靶向代谢组和靶向暴露组,极大地简化了代谢组-暴露组全关联研究(mEWAS)的流程,且在代谢物和外源性化合物的定性和定量能力上有显著提升。 在农业分子育种中的创新实践
分子育种旨在通过现代生物学技术精准改变植物遗传信息,培育优良性状品种。代谢组学在此过程中发挥着关键作用,SCIEX试剂为其提供了强大助力。针对小麦、水稻、玉米、番茄等多种作物,SCIEX开发了一系列代谢组学和脂质组学解决方案。以小麦和水稻为例,其提供的靶向分析方案专属性强、灵敏度高、稳定性好,能够有效区分不同品种。在玉米研究中,通过非靶向代谢组学分析,鉴定出330个代谢物,清晰揭示了不同品种玉米间代谢物的明显差异;非靶向脂质组学方法也鉴定出大量脂质成分,并筛选出众多差异脂质类别。此外,针对拟南芥和番茄等模式植物的广靶代谢组分析方案,鉴定出丰富的代谢物,为作物品质改良和植物代谢生物学研究积累了宝贵知识和资源。同时,在植物激素、类胡萝卜素等功能性成分的精准定量方面,SCIEX液相色谱串联质谱法展现出高灵敏度、抗基质干扰等优势,满足了复杂植物基质中低含量成分的检测需求,为植物生长发育和应对胁迫等研究提供了重要支持。